基序和纯度分数的计算

以下对这两个概念的详细解释：

基序

纯度分数

PWM矩阵的来源

为什么会有PWM矩阵？

一个特定的转录因子（TF）的结合位点的基序（motif）并不是唯一的。实际上，TF结合位点通常具有一定的序列变异性，这意味着它们可以结合多种略有不同的DNA序列。这种变异性允许TF在不同的基因组位置上结合，但仍然保持一定的序列偏好性。为了描述这种偏好性，研究人员通过统计分析构建了位置权重矩阵（PWM）。