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统计染色体长度信息-脚本009

2025/2/22 2:15:58 来源:https://blog.csdn.net/weixin_44874487/article/details/145065659  浏览:    关键词:统计染色体长度信息-脚本009

一行代码统计染色体长度,不用seqkit,py脚本等等

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awk '/^>/ {if (seq) print substr(id,2), length(seq); id=$0; seq=""} !/^>/ {seq=seq$0} END {if (seq) print substr(id,2), length(seq)}' XX.t2t.fa > lengths.txt

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