1.网络结构
结构可以分为两部分 左边部分是编码结构,进行特征提取 右边是解码结果,进行特征还原
2.数据集准备
import os.path
from torchvision import transforms
from torch.utils.data import Dataset
from utils import *#数据归一化
transform = transforms.Compose([transforms.ToTensor()
])class MyDataset(Dataset):def __init__(self,path):self.path = path#获取索引的名字 E:\Pcproject\LB-UNet-main\isic2018\trainself.name = os.listdir(os.path.join(path,'masks'))def __len__(self):return len(self.name)def __getitem__(self,index):segment_name = self.name[index]segment_path = os.path.join(self.path,'masks',segment_name)#原图地址image_path = os.path.join(self.path,'images',segment_name)#规范图片的大小尺寸segment_image = keep_image_size_open(segment_path)image = keep_image_size_open(image_path)return transform(image),transform(segment_image)if __name__=='__main__':data = MyDataset('E:/Pcproject/pythonProjectlw/UNet')print(data[0][0].shape)print(data[0][0].shape)
数据图片规范函数:
from PIL import Imagedef keep_image_size_open(path,size = (256,256)):#打开图像文件img = Image.open(path)#取最长边 获取图像尺寸 最长边temp = max(img.size)#创建空白图像mask = Image.new('RGB',(temp,temp),(0,0,0))#粘贴原始图像mask.paste(img,(0,0))#调整图像大小mask = mask.resize(size)#返回调整后的图像return mask
下面是数据的文件位置
数据集是皮肤病理分析的图片
根据unet网络结构可知有三个结构 一部分是conv卷积 一部分是上采样 一部分是下采样
3.定义板块
1.卷积模块
from torch import nn#卷积板块
class Conv_Block(nn.Module):def __init__(self,in_channel,out_channel):super(Conv_Block,self).__init__()self.layer = nn.Sequential(#第一个卷积#padding_mode='reflect':填充的是镜像数值 比如第一行第一个数是1 第二行第1列是2 那么在第一行上面填充的值就是以1为中心对称的数字2#可以将填充的数值也作为特征 加强特征提取的能力nn.Conv2d(in_channel,out_channel,3,1,1,padding_mode='reflect',bias=False),nn.BatchNorm2d(out_channel),nn.Dropout(0.3),nn.LeakyReLU(),#第二个卷积nn.Conv2d(out_channel, out_channel, 3, 1, 1, padding_mode='reflect', bias=False),nn.BatchNorm2d(out_channel),nn.Dropout(0.3),nn.LeakyReLU())def forward(self,x):return self.layer(x)
padding_mode='reflect':填充的是镜像数值 比如第一行第一个数是1 第二行第1列是2 那么在第一行上面填充的值就是以1为中心对称的数字2,可以将填充的数值也作为特征 加强特征提取的能力
2.下采样模块
图中的的max pool最大池化进行下采样 但是最大池化没有特征提取 丢特征丢的太多了
#下采样模块
class DownSample(nn.Module):def __init__(self,channel):super(DownSample,self).__init__()self.layer = nn.Sequential(nn.Conv2d(channel,channel,3,2,1,padding_mode='reflect',bias=False),nn.BatchNorm2d(channel),nn.LeakyReLU())def forward(self,x):return self.layer(x)
如果使用最大池化的化:
class DownSample(nn.Module):def __init__(self, channel):super(DownSample, self).__init__()self.layer = nn.Sequential(nn.MaxPool2d(2), # 使用最大池化替换卷积操作nn.BatchNorm2d(channel),nn.LeakyReLU())def forward(self, x):return self.layer(x)
3.上采样模块
使用插值法:
from torch.nn import functional as F
class UpSample(nn.Module):def __init__(self,channel):super(UpSample,self).__init__()self.layer = nn.Conv2d(channel,channel//2,1,1)def forward(self,x,feature_map):up = F.interpolate(x,scale_factor=2,mode='nearest')out = self.layer(up)return torch.cat((out,feature_map),dim=1)
super(UpSample, self).__init__() :
创建一个卷积层self.layer,它将输入通道数从channel减少到channel//2(即通道数减半)。
使用1x1的卷积核和步长为1,这意味着卷积层不会改变输入特征图的空间维度(高度和宽度)。
但是,它会改变通道数,因为输出通道数被设置为channel//2。
self.layer = nn.Conv2d(channel, channel//2, 1, 1)
使用F.interpolate函数对输入特征图x进行上采样。
scale_factor=2表示将特征图的高度和宽度都放大两倍。
mode='nearest'表示使用最近邻插值方法。
up = F.interpolate(x, scale_factor=2, mode='nearest')
将上采样后的特征图通过之前定义的卷积层self.layer
这将减少通道数(从原始通道数减半),同时保持(或可能稍微改变,取决于卷积层的权重初始化)空间维度。
根据结构:上采样时需要对上一个特征进行拼接:
使用torch.cat在通道维度(dim=1)上将输出特征图out和额外的特征图feature_map进行拼接。
这意味着输出特征图的通道数将是out的通道数加上feature_map的通道数。
4.定义Unet网络
class UNet(nn.Module):def __init__(self):super(UNet,self).__init__()#下卷积采样self.c1 = Conv_Block(3,64)self.d1 = DownSample(64)self.c2 = Conv_Block(64,128)self.d2 = DownSample(128)self.c3 = Conv_Block(128,256)self.d3 = DownSample(256)self.c4 = Conv_Block(256,512)self.d4 = DownSample(512)self.c5 = Conv_Block(512,1024)#上采样self.u1 = UpSample(1024)self.c6 = Conv_Block(1024,512)self.u2 = UpSample(512)self.c7 = Conv_Block(512,256)self.u3 = UpSample(256)self.c8 = Conv_Block(256,128)self.u4 = UpSample(128)self.c9 = Conv_Block(128,64)#输出self.out = nn.Conv2d(64,3,3,1,1)self.Th = nn.Sigmoid()def forward(self,x):R1 = self.c1(x)R2 = self.c2(self.d1(R1))R3 = self.c3(self.d2(R2))R4 = self.c4(self.d3(R3))R5 = self.c5(self.d4(R4))#拼接o1 = self.c6(self.u1(R5,R4))o2 = self.c7(self.u2(o1, R3))o3 = self.c8(self.u3(o2, R2))o4 = self.c9(self.u4(o3, R1))return self.Th(self.out(o4))if __name__ == '__main__':x = torch.randn(2,3,256,256)net = UNet()print(net(x).shape)
5.训练代码
import os.path
from torchvision import transforms
from torch.utils.data import Dataset
from utils import *#数据归一化
transform = transforms.Compose([transforms.ToTensor()
])class MyDataset(Dataset):def __init__(self,path):self.path = path#获取索引的名字 E:\Pcproject\LB-UNet-main\isic2018\trainself.name = os.listdir(os.path.join(path,'masks'))def __len__(self):return len(self.name)def __getitem__(self,index):segment_name = self.name[index]segment_path = os.path.join(self.path,'masks',segment_name)#原图地址image_path = os.path.join(self.path,'images',segment_name)#规范图片的大小尺寸segment_image = keep_image_size_open(segment_path)image = keep_image_size_open(image_path)return transform(image),transform(segment_image)if __name__=='__main__':data = MyDataset('E:/Pcproject/pythonProjectlw/UNet')print(data[0][0].shape)print(data[0][0].shape)
6.结果
如果是第一次运行 第一行结果会是加载失败
下面是文件夹中的内容: